MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-6

Total Repeats: 660

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017408	TAT	2	6	5	10	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017408	AAGAT	2	10	22	31	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017408	AAATA	2	10	51	60	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017408	ATT	2	6	74	79	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017408	ATA	2	6	111	116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017408	ATT	2	6	137	142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826487
7	NC_017408	TC	3	6	292	297	0 %	50 %	0 %	50 %	387826487
8	NC_017408	A	6	6	308	313	100 %	0 %	0 %	0 %	387826487
9	NC_017408	TGC	2	6	347	352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826487
10	NC_017408	ATT	2	6	413	418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826487
11	NC_017408	GAT	2	6	453	458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826487
12	NC_017408	CCA	2	6	492	497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826487
13	NC_017408	ATT	2	6	578	583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826487
14	NC_017408	T	7	7	614	620	0 %	100 %	0 %	0 %	387826487
15	NC_017408	A	7	7	621	627	100 %	0 %	0 %	0 %	387826487
16	NC_017408	TTG	2	6	656	661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826487
17	NC_017408	GAT	2	6	673	678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826487
18	NC_017408	TAT	2	6	712	717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826487
19	NC_017408	TGA	2	6	788	793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826487
20	NC_017408	AGC	2	6	860	865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826487
21	NC_017408	CAT	2	6	874	879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826487
22	NC_017408	T	7	7	970	976	0 %	100 %	0 %	0 %	387826487
23	NC_017408	CTT	2	6	982	987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826487
24	NC_017408	T	7	7	991	997	0 %	100 %	0 %	0 %	387826487
25	NC_017408	AAT	2	6	1021	1026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826487
26	NC_017408	ATTT	2	8	1141	1148	25 %	75 %	0 %	0 %	387826487
27	NC_017408	T	6	6	1146	1151	0 %	100 %	0 %	0 %	387826487
28	NC_017408	AACA	2	8	1190	1197	75 %	0 %	0 %	25 %	387826487
29	NC_017408	AATA	2	8	1205	1212	75 %	25 %	0 %	0 %	387826487
30	NC_017408	T	7	7	1225	1231	0 %	100 %	0 %	0 %	387826487
31	NC_017408	TTG	2	6	1234	1239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826487
32	NC_017408	T	6	6	1288	1293	0 %	100 %	0 %	0 %	387826488
33	NC_017408	TCT	2	6	1298	1303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826488
34	NC_017408	TCA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826488
35	NC_017408	TTA	2	6	1349	1354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826488
36	NC_017408	AAC	2	6	1379	1384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826488
37	NC_017408	AGCC	2	8	1408	1415	25 %	0 %	25 %	50 %	387826488
38	NC_017408	TTC	2	6	1456	1461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826488
39	NC_017408	TAA	2	6	1549	1554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826488
40	NC_017408	AT	3	6	1602	1607	50 %	50 %	0 %	0 %	387826488
41	NC_017408	A	8	8	1663	1670	100 %	0 %	0 %	0 %	387826488
42	NC_017408	T	6	6	1745	1750	0 %	100 %	0 %	0 %	387826488
43	NC_017408	ACAAA	2	10	1811	1820	80 %	0 %	0 %	20 %	387826488
44	NC_017408	AAG	2	6	1895	1900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826488
45	NC_017408	TTATAC	2	12	1953	1964	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017408	TTC	2	6	1966	1971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017408	AAT	2	6	1975	1980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017408	TCT	2	6	2013	2018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017408	ACT	2	6	2057	2062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017408	TAG	2	6	2088	2093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017408	AAT	2	6	2106	2111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017408	TAG	2	6	2136	2141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017408	ATA	2	6	2218	2223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017408	TAT	2	6	2224	2229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017408	AAT	2	6	2287	2292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826489
56	NC_017408	T	8	8	2309	2316	0 %	100 %	0 %	0 %	387826489
57	NC_017408	TAA	2	6	2322	2327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826489
58	NC_017408	T	6	6	2328	2333	0 %	100 %	0 %	0 %	387826489
59	NC_017408	T	6	6	2362	2367	0 %	100 %	0 %	0 %	387826489
60	NC_017408	CTT	2	6	2382	2387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826489
61	NC_017408	TAT	2	6	2424	2429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826489
62	NC_017408	TCT	2	6	2444	2449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826489
63	NC_017408	GTTT	2	8	2466	2473	0 %	75 %	25 %	0 %	387826489
64	NC_017408	T	7	7	2508	2514	0 %	100 %	0 %	0 %	387826489
65	NC_017408	T	6	6	2649	2654	0 %	100 %	0 %	0 %	387826489
66	NC_017408	TAT	2	6	2691	2696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826489
67	NC_017408	TTA	2	6	2748	2753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826489
68	NC_017408	TAT	2	6	2769	2774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826489
69	NC_017408	TTC	2	6	2785	2790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826489
70	NC_017408	CTTTTT	5	30	2829	2858	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387826489
71	NC_017408	ATTT	2	8	2865	2872	25 %	75 %	0 %	0 %	387826489
72	NC_017408	T	7	7	2888	2894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017408	GTC	2	6	2911	2916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017408	ATT	2	6	2930	2935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017408	CCA	2	6	2944	2949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017408	A	6	6	2972	2977	100 %	0 %	0 %	0 %	387826490
77	NC_017408	T	6	6	2992	2997	0 %	100 %	0 %	0 %	387826490
78	NC_017408	ATA	2	6	3006	3011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826490
79	NC_017408	CTC	2	6	3030	3035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826490
80	NC_017408	T	6	6	3102	3107	0 %	100 %	0 %	0 %	387826490
81	NC_017408	AAGC	2	8	3111	3118	50 %	0 %	25 %	25 %	387826490
82	NC_017408	TAT	2	6	3132	3137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826490
83	NC_017408	T	6	6	3145	3150	0 %	100 %	0 %	0 %	387826490
84	NC_017408	TATT	2	8	3209	3216	25 %	75 %	0 %	0 %	387826490
85	NC_017408	TGC	2	6	3285	3290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826490
86	NC_017408	TAT	2	6	3336	3341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826490
87	NC_017408	AGT	2	6	3380	3385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826490
88	NC_017408	AT	3	6	3461	3466	50 %	50 %	0 %	0 %	387826490
89	NC_017408	AC	3	6	3484	3489	50 %	0 %	0 %	50 %	387826490
90	NC_017408	TGT	2	6	3518	3523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826490
91	NC_017408	TTA	2	6	3544	3549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826490
92	NC_017408	TAG	2	6	3600	3605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826490
93	NC_017408	T	6	6	3609	3614	0 %	100 %	0 %	0 %	387826490
94	NC_017408	TTA	2	6	3692	3697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826490
95	NC_017408	T	6	6	3705	3710	0 %	100 %	0 %	0 %	387826490
96	NC_017408	T	7	7	3719	3725	0 %	100 %	0 %	0 %	387826490
97	NC_017408	TCC	2	6	3731	3736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826491
98	NC_017408	T	6	6	3746	3751	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
99	NC_017408	TA	3	6	3763	3768	50 %	50 %	0 %	0 %	387826491
100	NC_017408	T	6	6	3781	3786	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
101	NC_017408	ATT	2	6	3791	3796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826491
102	NC_017408	TTTCTT	2	12	3823	3834	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387826491
103	NC_017408	T	6	6	3833	3838	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
104	NC_017408	CAA	2	6	3842	3847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826491
105	NC_017408	T	6	6	3884	3889	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
106	NC_017408	TAT	2	6	3934	3939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826491
107	NC_017408	CTTT	2	8	3942	3949	0 %	75 %	0 %	25 %	387826491
108	NC_017408	T	6	6	3962	3967	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
109	NC_017408	GTC	2	6	4004	4009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387826491
110	NC_017408	T	7	7	4010	4016	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
111	NC_017408	AAT	2	6	4036	4041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826491
112	NC_017408	T	8	8	4043	4050	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
113	NC_017408	T	8	8	4093	4100	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
114	NC_017408	T	6	6	4148	4153	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
115	NC_017408	TCT	2	6	4164	4169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826491
116	NC_017408	T	6	6	4187	4192	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
117	NC_017408	T	8	8	4223	4230	0 %	100 %	0 %	0 %	387826491
118	NC_017408	ACT	2	6	4250	4255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826491
119	NC_017408	T	8	8	4269	4276	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
120	NC_017408	ATT	2	6	4294	4299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826492
121	NC_017408	TAT	2	6	4303	4308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826492
122	NC_017408	GTT	2	6	4331	4336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826492
123	NC_017408	T	6	6	4340	4345	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
124	NC_017408	TAG	2	6	4353	4358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826492
125	NC_017408	ATC	2	6	4363	4368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826492
126	NC_017408	TTTAG	2	10	4451	4460	20 %	60 %	20 %	0 %	387826492
127	NC_017408	TAA	2	6	4531	4536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826492
128	NC_017408	T	6	6	4541	4546	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
129	NC_017408	T	6	6	4561	4566	0 %	100 %	0 %	0 %	387826492
130	NC_017408	AATTC	2	10	4583	4592	40 %	40 %	0 %	20 %	387826492
131	NC_017408	AAAG	2	8	4597	4604	75 %	0 %	25 %	0 %	387826492
132	NC_017408	TTA	2	6	4622	4627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826492
133	NC_017408	TA	4	8	4626	4633	50 %	50 %	0 %	0 %	387826492
134	NC_017408	TA	3	6	4636	4641	50 %	50 %	0 %	0 %	387826492
135	NC_017408	TAT	2	6	4647	4652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826492
136	NC_017408	TCTT	2	8	4700	4707	0 %	75 %	0 %	25 %	387826492
137	NC_017408	TCTT	2	8	4721	4728	0 %	75 %	0 %	25 %	387826492
138	NC_017408	TTAA	2	8	4736	4743	50 %	50 %	0 %	0 %	387826492
139	NC_017408	CTA	2	6	4757	4762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826492
140	NC_017408	ATCA	2	8	4771	4778	50 %	25 %	0 %	25 %	387826492
141	NC_017408	TA	3	6	4805	4810	50 %	50 %	0 %	0 %	387826492
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